Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DmdP11531 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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DmdP11531 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DmdP11531 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms