Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
UbbP0CG49 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms