Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01878 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01878 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01878 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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