Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1077.1 ms