Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Alx4O35137 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Alx4O35137 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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