Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 AC122197.1-201ENSMUST00000220281 2142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rpap3-ps2-201ENSMUST00000184741 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Zmym1-203ENSMUST00000106102 3852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Foxp3-201ENSMUST00000045566 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcshO08795 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms