Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm2035J3QP87 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm2035J3QP87 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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