Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms