Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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