Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Taf4bG5E8Z2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Taf4bG5E8Z2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Taf4bG5E8Z2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Taf4bG5E8Z2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms