Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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