Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms