Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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