Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ssxb8B1AY40 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ssxb8B1AY40 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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