Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms