Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprfA2A8L5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprfA2A8L5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprfA2A8L5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms