Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt6bQ9Z331 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Krt6bQ9Z331 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt6bQ9Z331 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt6bQ9Z331 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt6bQ9Z331 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt6bQ9Z331 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt6bQ9Z331 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms