Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Top3bQ9Z321 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms