Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl40Q9Z2Q5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.6 ms