Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crlf3Q9Z2L7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms