Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn6Q9Z262 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn6Q9Z262 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms