Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uso1Q9Z1Z0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms