Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr5Q9Z1P4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms