Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shcbp1Q9Z179 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms