Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dctn3Q9Z0Y1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms