Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1pr4Q9Z0L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
S1pr4Q9Z0L1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms