Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmfbp1Q9WVQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms