Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ArcQ9WV31 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms