Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp1a4Q9WV27 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms