Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM4

Coro1c, Coronin-1C, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1cQ9WUM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1cQ9WUM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1cQ9WUM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1cQ9WUM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms