Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn5Q9WU28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms