Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggps1Q9WTN0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms