Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubd1Q9R1K7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubd1Q9R1K7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubd1Q9R1K7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms