Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabrg1Q9R0Y8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg1Q9R0Y8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms