Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NrkQ9R0G8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NrkQ9R0G8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NrkQ9R0G8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms