Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcamQ9R069 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms