Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhl3Q9R059 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhl3Q9R059 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms