Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmfrQ9R049 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms