Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtsjQ9R014 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtsjQ9R014 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms