Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3Q9QZS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms