Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp21Q9QZL6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp21Q9QZL6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms