Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc4Q9QZD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc4Q9QZD4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms