Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms