Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snai3Q9QY31 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snai3Q9QY31 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Snai3Q9QY31 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snai3Q9QY31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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