Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb11Q9QY30 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms