Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Foxe3Q9QY14 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxe3Q9QY14 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxe3Q9QY14 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms