Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms