Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmQ9QXG2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmQ9QXG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms