Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc5Q9QX29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc5Q9QX29 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms