Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3a1Q9QX15 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms